故事的发生地是在一座名为星元市的小城市。 在市内的狮子尾山上，耸立着一个闪耀着彩色光芒的巨大物体，这个被命名为“摩诺之角”的物体，实际上是16年前“怪兽之日”事件发生之后就矗立在那里的“怪兽的角”。 在世界各地同时出现怪兽的“怪兽之日”事件发生之后，怪兽灾害开始变得日常。日本的地球防卫队开始以武力对付怪兽的同时，怪兽防灾科学调查所（统称SKIP Scientific Kaiju Investigation and Prevention center）也为了防止怪兽灾害的发生和受灾情况扩大，不断对各地区进行科学调查和避难引导。这个组织时至今日，还在不停地调查“怪兽之日”出现的原因和城市中的“摩诺之角”。 年仅7岁的“优马”在狮子尾山与父母露营时，遭遇了怪兽袭击，他奇迹般地生还并毫发无伤。以此为契机，“优马”踏上了研究怪兽生物学的道路。虽然有着痛苦的过去，但优马没有失去梦想，他依靠“想象的力量”成长起来，作为新手调查员加入了“SKIP”，被分配到了星元市分所。 就在这时，星元市发生了大规模的怪兽灾害。“想要保护眼前这些穷途末路的人们!”这个强烈而直接的想法从心底涌出的瞬间，“优马”的脑海中出现了儿时见过的光之使者“卢提昂”在和他说话：“我就是你，你就是我... ... 释放你的想象力!” 出现在手中的神秘之光包裹住优马的身体，释放出的想象之力将光与人结合在一起，守护未来的光之巨人“亚刻奥特曼”变身! 优马以及亚刻奥特曼与重要的伙伴一起，追逐着永不停歇的梦想，从现在开始奔跑!
美雪（上野树里 饰）收到朋友的邀请函，邀请去“废墟之乡”小度周末，美雪喊上同学和青梅竹马的金田一（龟梨和也 饰）一同前往，临时被同学放鸽子，变成了2人独行。在废墟之乡的一家旅馆，同住的还有警察剑持（加藤雅也 饰）、摄影师、小说家、医生等几个人，旅馆员工凑青子温柔大方，旅馆老板在饭后给大家讲了当地流传的吸血鬼的故事。 50年前，这里搬来一户罗马尼亚人，被大家误以为是吸血鬼，村民放了一场大火，事后却没找到儿子的尸体，从此天天有人死于吸血鬼之口。50年后，一家三口搬到这里开了旅馆，经济泡沫导致破产后夫妇自杀，剩下的一个女儿6年前神秘死去，身上的血都被抽干了。 故事讲到这里楼上传来惊叫声，一名女子死去，美雪恰好是事件的目击者，次日又一而再再而三有人死去，所有的矛头都直指美雪，一直逃避侦探爷爷大名的金田一，为了保护最重要的人，决定找出案件的真相。
在日本这一“怪兽大国”，人们的日常生活遭受着怪兽的无情破坏。 主人公日比野卡夫卡，小时候住的城市遭到破坏，他与青梅竹马亚白米娜做出了“将怪兽全部消灭”的约定。 然而，32岁的卡夫卡梦想破灭，就职于一家怪兽尸体解体公司“怪兽清洁公司”。 相比米娜作为日本防卫队队员而日渐活跃，卡夫卡每天都过着忧郁的生活。 过来打工的市川莱诺告诉他，防卫队的年龄限制将会提高，并劝他去参加入队考试。 于是重新下定决心的卡夫卡，却突然受到神秘生物的侵蚀，身体开始怪兽化，被称为“怪兽8号”。
传说中灵熙国的麒麟鼎能让人奇力倍增，众羊狼携皓月及力将军慕名而至。不料奇力没增成，喜羊羊却意外卷入风波生命垂危，为救喜羊羊，众守护者在灵熙国展开了大营救，到底有怎样的危机等着大家呢，喜羊羊又能否化险为夷，且看大营救系列第三部。
