在火星发现的神秘箱子――“潘多拉魔盒”打开的瞬间，巨大的墙壁突然出现！故事由此开始。被称为“天空之墙”的墙壁把日本列岛分割为三部分，并由此诞生了各自的首都「东都」「西都」「北都」。 其中在“东都”有被称为Smash的未确认生命体出现并暗中把人类逼入绝境。挡在Smash面前而出现的，是一位青年，其腰上戴着腰带、 手上握着不可思议的瓶子 。「变身！」―― 青年天才物理学者变身为假面骑士Build，阻挡在Smash的面前！
最强2人，回不去的青春。2017年12月，乙骨忧太解除了祈本里香的诅咒。追溯到2006年（春天），高专时代的五条悟与夏油杰。作为咒术师活跃着，所向披靡的2人，接受来自咒术界拥有不死术式的要·天元的委托。委托有两个，天元的的适合者——被选中成为“星浆体”的天内理子，对那个少女的“护卫”和“抹去”两人为了维持咒术界而进行护卫任务，在那里自称伏黑的“术师杀手”以暗杀“星浆体”为目标介入。在之后被称为最强的咒术师和最恶的咒术师，五条与夏油，两人的过去被揭开…
2033年，人类阻挡小行星撞击地球的计划失败了，人类灭亡了，而被遗忘在月球上的中等动物研究员独孤月幸运的活了下来，成为全宇宙最后一个人类。但这并不值得高兴，虽然月球基地物资充沛，除此之外，陪伴他的只有无尽的孤独。他开始锻炼身体、探索基地、创作漫画，不知不觉竟然将自己在月球上的孤独生活过出了乐趣。然而他不知道的是，基地摄像机将他的视频画面传回了地球，全球的幸存人类在地球上直播观看他的月球生活，并将他视为榜样。直到有一天，他发现自己没动过的蛋糕上有一个牙印.....难道月球上还有什么别的存在？
